TP.HCM phát hiện biến thể Ấn Độ và biến thể Anh trong chuỗi ca bệnh mới nhất

Nhóm nghiên cứu Covid-19 của Bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới và Đơn vị Nghiên cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford đã tiến hành giải mã nhanh bộ gene của SARS-CoV-2 của chuỗi 2 ca bệnh tại thành phố Hồ Chí Minh.

Chuỗi đầu tiên liên quan tới Bệnh nhân BN4583 cư ngụ tại Quận 7. Bệnh nhân này có liên quan đến BN4514 cư trú tại Thành phố Thủ Đức. Đây là chùm ca lây nhiễm tại cộng đồng ghi nhận hôm 18/5/2021. Kết quả giải mã gene cho thấy BN4583 nhiễm biến chủng B.1.617.2 của Ấn Độ.

Chuỗi thứ 2 là của BN4780 liên quan đến chuỗi lây nhiễm tại Quận 3 ghi nhận hôm 20/5/2021,  giải mã bộ gene virus cho kết quả nhiễm biến chủng B.1.1.7 của Anh.

Kết hợp kết quả giải mã gene với thông tin dịch tễ, có thể khẳng định: hai bệnh nhân BN4583 và BN4514 có cùng một nguồn lây do biến chủng B.1.617.2 (biến chủng Ấn Độ). Còn BN4780 nhiễm biến chủng B.1.1.7. Biến chủng B.1.1.7 gây bệnh tại Đà Nẵng và Hà Nam. Hai chuỗi lây nhiễm này do hai biến chủng khác nhau gây bệnh.

Đây là lần đầu tiên TP.HCM ghi nhận sự lây nhiễm trong cộng đồng đồng thời của cả hai biến chủng được cho là có khả năng lây lan nhanh.

Được biết nhóm nghiên cứu sử dụng phương pháp giải mã gene bằng kỹ thuật Illumina MiSeq và MinION. Phần mềm lắp ghép bộ gene Genious. Định danh biến chủng bằng phần mềm Pangolin và tìm đột biến bằng phần mềm COV-GLUE.

Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy: mẫu từ BN4583 là B.1.617.2, mẫu từ BN4780: B.1.1.7. Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy các bộ gene thu nhận chứa các đột biến tiêu biểu của biến chủng B.1.1.7 và  biến chủng B.1.617.2 tương ứng.

Theo Ngọc Minh (Doanh nghiệp & Tiếp thị)